Le variant Delta inquiète : 28 cas et 3 clusters confirmés en une semaine à La Réunion

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La circulation virale reste active sur l’ensemble du territoire avec une détérioration des indicateurs de suivi épidémiologique et d’impact sanitaire. De plus, la présence du variant Delta a été confirmé, avec plusieurs chaînes de transmission autochtones laisse présager une augmentation de l’incidence.

Les derniers chiffres publiés par Santé Publique France sont inquiétants :

► Le taux d’incidence repart à la hausse après une diminution ces 4 dernières semaines. En S25, il était de 140/100 000 habitants contre 123/100 0000 la semaine précédente. Cette augmentation concerne toutes les classes d’âges et particulièrement : les 45-64 ans (+24%), les 65-74 ans (+66%) et les 75 ans et plus (+13%).
► Le taux de dépistage était stable à 3 334/100 000 habitants en S25 comparé à 3 313/100 000 habitants en S24.
► Le taux de positivité des personnes testées repart à la hausse après une diminution de 5 semaines consécutives.
En S25, le taux de positivité était de 4,2% contre 3,7% la semaine précédente.
► Entre le 20 et le 26 juin 2021, 10 des 24 communes présentaient un TI supérieur à 100/100 000 habitants (> 10 cas), dont 7
communes avec un TI supérieur à 150/100 000 habitants : Le Port (436/100 000), La Possession (262/100 000), Les TroisBassins (236/100 000), Saint-Leu (180/100 000), Saint-Louis (177/100 000), Saint-Pierre (174/100 000) et Petite-Ile (163/100 000)

► En S25, 16 nouveaux clusters ont été signalés. Nous observons une augmentation du nombre de clusters identifiés.
► Depuis juin 2020, 358 clusters ont été signalés dont 310 ont été clôturés soit, 86% des clusters (données au 01 juillet 2021).
► Parmi les 35 clusters actifs :
• 10 clusters à criticité élevée se situant à la Plaine des Palmistes(1), au Port (1), à Saint-André (1), à Saint-Leu (1), à Saint Paul (3) et à Saint Pierre(3).
• 15 clusters à criticité modérée se situant au la Plaine des Cafres(1), la Plaine des Palmistes(1), au Port (5), SaintDenis (4) Sainte-Suzanne (1) Saint-Paul(1) et Saint Pierre(2).

► A ce jour, trois clusters sont en lien avec le variant Delta, confirmé le 25/06/2021 par séquençage. Ces trois clusters comptabilisent 28 cas. Les situations ne sont pas liées entre elles. Un seul cluster aurait un lien avec un cas importé de métropole.

Entre le 01/03/2020 et le 30/06/2021, 243 décès de patients hospitalisés ont été signalés. En S25, 10 décès ont été recensés comparés à 7 décès la semaine précédente

Hospitalisations en lien avec la COVID-19 (SI-VIC)

► En diminution depuis 5 semaines, le nombre de nouvelles hospitalisations augmente à nouveau avec 73 nouvelles hospitalisations enregistrées en S25 comparées à 57 en S24 soit une augmentation de 28%

Admissions en réanimation en lien avec la COVID-19 (SI-VIC)

► Le nombre de nouvelles admissions en réanimation est en augmentation (alors qu’elles diminuaient depuis 4 semaines) avec 18 nouvelles admissions en réanimation en S25 (12 en S24)

Une nouvelle stratégie nationale de criblage systématique par RT-PCR des tests positifs pour le SARS-CoV-2 a été mise en place à partir du 31/05/2021 et permet de cibler les trois mutations d’intérêt E484K (portée notamment par les variants Beta et Gamma), E484Q et L452R (portée notamment par le variant Delta). Toutefois, ces mutations ne sont pas encore systématiquement recherchées dans l’ensemble des tests criblés. Les données publiées dans ce Point épidémiologique sont un premier point de mesure.

A La Réunion, en S25, 53,4% des tests ont été criblés avec les nouveaux tests de criblage. La mutation E484K a été identifiée dans 94,5% des échantillons criblés (n=716) et la mutation L452R dans 1,1% des échantillons criblés (n=4). La mutation E484Q n’a pour l’instant pas été identifiée.

La Réunion se caractérise par une présence très majoritaire du variant Beta (20H/501Y.V2) qui représente plus de 90% des échantillons séquencés. Le variant Delta (21A/478K) a été détecté et confirmé par séquençage le 25/06/2021. Depuis sa détection, plusieurs chaînes de transmission autochtones ont été identifiées, dont trois clusters. Cette diffusion du variant Delta est suivie avec la plus grande attention, compte tenu de sa transmissibilité accrue (+60%) par rapport aux souches virales de référence et au VOC Alpha.

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