Inde, le séquençage du génome par INSACOG montre des variants préoccupants et un nouveau variant.
l’Inde comptabilise 11 846 082 cas de coronavirus, 160 983 décès et 11 262 503 guérisons.
Un nouveau variant de la Covid-19 a été détecté en Inde, et il inquiète les autorités. Car il est plus transmissible et plus dangereux, a déclaré le ministère de la Santé indien.
« Le Consortium indien SARS-CoV-2 sur la génomique (INSACOG) est un groupe de 10 laboratoires indien qui a été créé par le ministère de la Santé et de la Protection de la famille du gouvernement indien le 25/12/2020. L’INSACOG effectue depuis lors le séquençage et l’analyse génomiques des virus COVID-19 en circulation, et corréle les tendances épidémiologiques avec les variantes génomiques. Les variantes génomiques de divers virus sont un phénomène naturel et se trouvent dans presque tous les pays.
Depuis le début de ses travaux par l’INSACOG, 771 variantes de préoccupations (COV) ont été détectées dans un total de 10787 échantillons positifs partagés par les États/UT. Il s’agit notamment de 736 échantillons positifs pour les virus de la lignée britannique (B.1.1.7). 34 échantillons ont été trouvés positifs pour les virus de la lignée sud-africaine (B.1.351). 1 échantillon a été trouvé positif pour les virus de la lignée brésilienne (P.1). Les échantillons contenant ces COV ont été identifiés dans 18 États du pays.
Le séquençage et l’analyse du génome ont été effectués sur des échantillons de voyageurs internationaux arrivant, des contacts de personnes positives pour les COV et des échantillons communautaires de la plupart des États dans les laboratoires partenaires de l’INSACOG qui sont au nombre de 10.
L’analyse d’échantillons du Maharashtra a révélé que par rapport à décembre 2020, il y a eu une augmentation de la fraction d’échantillons présentant les mutations E484Q et L452R. De telles mutations confèrent une évasion immunitaire et une infectiosité accrue. Ces mutations ont été trouvées dans environ 15 à 20 % des échantillons et ne correspondent à aucun COV précédemment catalogué. Ceux-ci ont été classés comme COV, mais nécessitent la même réponse épidémiologique et de santé publique que « l’augmentation du dépistage, le suivi complet des contacts étroits, l’isolement rapide des cas positifs et des contacts ainsi que le traitement conformément au protocole national de traitement » par les États/UT.
Du Kerala, 2032 échantillons (des 14 districts) ont été séquencés. La variante N440K associée à l’évasion immunitaire a été trouvée dans 123 échantillons de 11 districts. Cette variante a été précédemment trouvée dans 33 % des échantillons de l’Andhra Pradesh et dans 53 des 104 échantillons du Telangana. Cette variante a également été signalée dans 16 autres pays, dont le Royaume-Uni, le Danemark, Singapour, le Japon et l’Australie. À partir de maintenant, on peut au mieux dire qu’il s’agit d’une variante faisant l’objet d’une enquête.
Bien que des COV et une nouvelle variante double mutant aient été trouvés en Inde, ils n’ont pas été détectés en nombre suffisant pour établir ou diriger une relation ou expliquer l’augmentation rapide des cas dans certains États. Le séquençage génomique et les études épidémiologiques se poursuivent pour analyser plus avant la situation ».
